Hola Jose,
Básicamente sí, si lo que quieres exportar es un formato multicolumnas, con muchas cajas, tipo revista es muy complicado que ID siquiera se acerque al layout, ahí tienes que hacer todo el trabajo tú de maquetación web.
Si la maqueta es de un libro se acercará más, puedes dejar los estilos y luego editarlo en DW, la única ventaja es que ID añade estilos (clases) a los elementos aunque si dominas CSS no lo harías así.
Siento no poder ayudarte más, en resumen, si lleva poco estilo no tendrás muchas complicaciones aunque el interior del código no sea profesional, no tiene porqué notarse.
Saludos