Bueno pues llegué, puse también la consulta en los foros de adobe y allí primero un señor que no conocía Jose M. Ramos y luego el amigo Federico Platón me han llevado a la solución, el «truco» está en exportar en formato idml (formato nuevo en indesign cs4) y obtenemos la estructura del documento, se trata de documentos en formato xml pero que permite con un editor de texto, con el wordpad por ejemplo, modificar todo el documento. Para no aburriros y por si alguno está interesado pongo el enlace a los foros para que le echéis un vistazo.
http://forums.adobe.com/message/1912225#1912225
gracias a todos por vuestra colaboración
creo que hemos encontrado otra herramienta para «jugar» con indesign
un saludo
mateo