Hola Christian,
Hay muchas opciones, si usas un editor web como Dreamweaver que tiene un FTP integrado es una forma rápida de editar un archivo y subirlo, si son muchos archivos te aconsejaría el cliente FTP de código abierto Filezilla: http://filezilla-project.org/
También hay extensiones para Firefox: http://fireftp.mozdev.org/
Saludos